Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efhd1Q9D4J1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efhd1Q9D4J1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efhd1Q9D4J1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efhd1Q9D4J1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efhd1Q9D4J1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efhd1Q9D4J1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efhd1Q9D4J1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efhd1Q9D4J1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms