Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrp2bpQ9D4C6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrp2bpQ9D4C6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms