Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UvssaQ9D479 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UvssaQ9D479 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UvssaQ9D479 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UvssaQ9D479 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UvssaQ9D479 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms