Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4933421I07RikQ9D420 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933421I07RikQ9D420 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933421I07RikQ9D420 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933421I07RikQ9D420 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933421I07RikQ9D420 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933421I07RikQ9D420 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933421I07RikQ9D420 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933421I07RikQ9D420 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933421I07RikQ9D420 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933421I07RikQ9D420 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms