Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X5

Pacrgl, PACRG-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrglQ9D3X5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PacrglQ9D3X5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PacrglQ9D3X5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PacrglQ9D3X5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PacrglQ9D3X5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms