Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D2Q3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D2Q3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9D2Q3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D2Q3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D2Q3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms