Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc8bQ9D2D9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc8bQ9D2D9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc8bQ9D2D9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc8bQ9D2D9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc8bQ9D2D9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc8bQ9D2D9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc8bQ9D2D9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhdc8bQ9D2D9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms