Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chordc1Q9D1P4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chordc1Q9D1P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chordc1Q9D1P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms