Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hddc3Q9D114 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hddc3Q9D114 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hddc3Q9D114 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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