Protein–RNA interactions for Protein: Q9D073

2610042L04Rik, 2610042L04Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610042L04RikQ9D073 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2610042L04RikQ9D073 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
2610042L04RikQ9D073 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2610042L04RikQ9D073 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2610042L04RikQ9D073 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
2610042L04RikQ9D073 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610042L04RikQ9D073 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610042L04RikQ9D073 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610042L04RikQ9D073 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms