Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CenpnQ9CZW2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpnQ9CZW2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpnQ9CZW2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpnQ9CZW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms