Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab3bQ9CZT8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3bQ9CZT8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3bQ9CZT8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms