Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc77Q9CZH8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc77Q9CZH8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc77Q9CZH8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms