Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrtapQ9CYD3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrtapQ9CYD3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrtapQ9CYD3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms