Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChtopQ9CY57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChtopQ9CY57 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms