Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ist1Q9CX00 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ist1Q9CX00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ist1Q9CX00 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms