Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CWU4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CWU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CWU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9CWU4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CWU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CWU4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CWU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CWU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CWU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms