Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029F12RikQ9CRB4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029F12RikQ9CRB4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms