Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msmo1Q9CRA4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msmo1Q9CRA4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msmo1Q9CRA4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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