Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cox16Q9CR63 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cox16Q9CR63 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cox16Q9CR63 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cox16Q9CR63 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms