Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR34

Uncharacterized protein C5orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR34 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CR34 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CR34 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CR34 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CR34 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CR34 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CR34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CR34 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CR34 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CR34 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CR34 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CR34 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CR34 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CR34 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CR34 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CR34 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CR34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CR34 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CR34 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CR34 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CR34 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CR34 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CR34 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9CR34 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CR34 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CR34 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CR34 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CR34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CR34 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CR34 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CR34 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CR34 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CR34 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CR34 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CR34 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CR34 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CR34 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CR34 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CR34 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CR34 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CR34 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CR34 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CR34 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CR34 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CR34 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CR34 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CR34 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CR34 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CR34 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CR34 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CR34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CR34 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CR34 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms