Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gkn2Q9CQS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gkn2Q9CQS6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gkn2Q9CQS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gkn2Q9CQS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms