Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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