Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp1b2Q9CQD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp1b2Q9CQD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Chmp1b2Q9CQD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp1b2Q9CQD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms