Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CQC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CQC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CQC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CQC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CQC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CQC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CQC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CQC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9CQC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CQC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CQC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CQC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CQC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CQC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CQC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CQC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CQC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CQC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms