Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mid1ip1Q9CQ20 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mid1ip1Q9CQ20 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms