Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CPS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CPS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CPS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CPS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CPS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9CPS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms