Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim11Q99PQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim11Q99PQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim11Q99PQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim11Q99PQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim11Q99PQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim11Q99PQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim11Q99PQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim11Q99PQ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms