Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc4Q99PH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc4Q99PH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc4Q99PH1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc4Q99PH1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc4Q99PH1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc4Q99PH1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc4Q99PH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc4Q99PH1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms