Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcam1Q99NB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcam1Q99NB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcam1Q99NB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms