Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PtprtQ99M80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprtQ99M80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprtQ99M80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PtprtQ99M80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprtQ99M80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprtQ99M80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprtQ99M80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms