Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap3Q99LM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms