Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf34Q99KR6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf34Q99KR6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf34Q99KR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms