Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nlgn1Q99K10 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nlgn1Q99K10 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nlgn1Q99K10 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Nlgn1Q99K10 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nlgn1Q99K10 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nlgn1Q99K10 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nlgn1Q99K10 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nlgn1Q99K10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nlgn1Q99K10 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms