Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf144aQ925F3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf144aQ925F3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf144aQ925F3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf144aQ925F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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