Protein–RNA interactions for Protein: Q920B0

Frmd4b, FERM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4bQ920B0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4bQ920B0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd4bQ920B0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd4bQ920B0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4bQ920B0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms