Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc1Q91Z38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc1Q91Z38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttc1Q91Z38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc1Q91Z38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms