Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco4Q91WU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco4Q91WU4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmco4Q91WU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco4Q91WU4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms