Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnot6lQ8VEG6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot6lQ8VEG6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnot6lQ8VEG6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot6lQ8VEG6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot6lQ8VEG6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnot6lQ8VEG6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms