Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep57l1Q8VDS7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep57l1Q8VDS7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep57l1Q8VDS7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep57l1Q8VDS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms