Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd2Q8VDM4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd2Q8VDM4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmd2Q8VDM4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd2Q8VDM4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd2Q8VDM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms