Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bles03Q8VD62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bles03Q8VD62 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bles03Q8VD62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bles03Q8VD62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms