Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpap2Q8VC34 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpap2Q8VC34 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpap2Q8VC34 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpap2Q8VC34 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms