Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc137Q8R0K4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc137Q8R0K4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc137Q8R0K4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc137Q8R0K4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc137Q8R0K4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc137Q8R0K4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms