Protein–RNA interactions for Protein: Q8K561

Otoa, Otoancorin, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtoaQ8K561 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtoaQ8K561 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtoaQ8K561 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtoaQ8K561 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtoaQ8K561 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms