Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colec12Q8K4Q8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Colec12Q8K4Q8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec12Q8K4Q8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Colec12Q8K4Q8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms