Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ltbp4Q8K4G1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ltbp4Q8K4G1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ltbp4Q8K4G1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ltbp4Q8K4G1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ltbp4Q8K4G1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ltbp4Q8K4G1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ltbp4Q8K4G1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ltbp4Q8K4G1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ltbp4Q8K4G1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ltbp4Q8K4G1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ltbp4Q8K4G1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms