Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Paf1Q8K2T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Paf1Q8K2T8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Paf1Q8K2T8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Paf1Q8K2T8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms