Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mtmr3Q8K296 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mtmr3Q8K296 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mtmr3Q8K296 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtmr3Q8K296 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtmr3Q8K296 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mtmr3Q8K296 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mtmr3Q8K296 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms