Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gin1Q8K259 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gin1Q8K259 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gin1Q8K259 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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